月经期肛门疼可能是由于患者在月经期间整个盆腔有充血的情况，进而导致了肛门的坠胀疼痛等症状，另外，如果患者患有直肠黏膜下的脓肿或是肛周脓肿是，也会引起月经期间肛门疼的情况，还有一种常见情况，就是患者本身出现了肛裂，肛裂会在肛门的皮肤处有一个裂口，导致患者出现明显的疼痛感。
建议患者及时到医院进行检查，明确病因，再根据医生的指导进行治疗