患者总是半夜三点醒的原因可能是以下几种：
1.作息时间的问题，如果长时间的早睡也可能出现早醒的状况，这要依据人的作息时间规律来查看是否异常。
2.可能是因为最近遇到焦虑或者心烦的事情引起思虑过度而出现的，必要时可以给予改善思虑过度的药物来口服。
3.可能是器质性的疾病引起的，临床上较为多见的是胃炎、胃溃疡或者是心律失常等，此时建议病人必要的时候可以口服抑酸和保护胃黏膜的药。最后，冠心病的病人因为夜间迷走神经兴奋可以出现心慌和胸闷等症状，也能引起人凌晨三点醒。 建议患者及时到医院就诊，查明病因后，在医生的指导下进行治疗。