结肠恶变通常使用手术治疗。也可采用中药治疗，可以改善症状，增强机体抗病能力。
1、治疗结肠恶变首先用手术方法。结肠恶变以后很容易会出现转移，恶化的几率比较高，发病部位以结肠、乙状结肠和直肠为主的肛肠病。结肠恶变包含有结肠、半结肠以及状结肠恶变肿的根治切除术等。
2、根据中医整体观念，可针对不同病因，进行多角度治疗。中医辨证论治的优势充分发挥，疗效显著。本病的特点有虚实夹杂、寒热错杂，需调理肝肾脾胃，增强体质，达到机体抗病毒的目的。慢性腹泻需标本兼治，起到涩肠止泻的功效。
3、为防止病变，慢性腹泻应早做钡灌肠或者结肠镜的检查。
4、此外，还有免疫疗法、干扰素、白细胞介素、转移因子等手段的应用，不仅可改善症状，还能增强机体的抗病能力。平时还要注意饮食，少吃辛辣刺激的食物。