胃镜能检查出幽门螺杆菌。胃镜检查幽门螺杆菌需要取一小块胃黏膜的组织放到含有尿素的溶液中，幽门螺杆菌有尿素酶能够分解尿素从而产生化学反应。
检查幽门螺杆菌比较普及的是无创性的检查，即碳13和碳14的呼气试验，是通过空腹以及口服一粒含有尿素的胶囊之后，分别呼两口气体来检测，准确性很高安全性也很好。