幽门螺杆菌抗体阳性，应该采用四联疗法治疗，常用的药物有质子泵抑制剂，如奥美拉唑肠溶胶囊、兰索拉唑等；胃黏膜保护剂，如复方铝酸铋颗粒、果胶铋等；
应用抗生素量药物，如阿莫西林、替硝唑、克拉霉素等。一般给予口服药物半个月到一个月，然后停药一个月去复查碳14的呼吸试验或者胃镜，判断幽门螺杆菌有没有被根治。
如果目前没有幽门螺杆菌感染，幽门螺杆菌抗体是既往感染留下的，那么不需要特殊处理。