头皮糠疹在治疗上比较难以根治，患者可以外用二硫化硒能、酮康唑等药物进行治疗，可以起到杀菌的作用，另外还可以使用硫磺、水杨酸等清洗头部，减少鳞屑产生。
当头皮糠疹症状较轻时，患者还可以口服维生素B维生素B2等药物来控制病情。建议患有头皮糠疹的患者及时到医院进行诊治，并在医生的指导下进行药物的使用，切勿自行盲目用药，以免出现不良反应。