生殖器上长水泡可能是湿疹导致的，也可能是生殖器疱疹导致的。
1、湿疹：一般可能是免疫功能异常、饮食不当等因素导致的，通常伴有瘙痒、红斑、水泡等症状，一般建议在医生指导下使用氧化锌软膏、氯雷他定片、盐酸西替利嗪片、玉屏风胶囊等药进行治疗，用药谨遵医嘱。
2、生殖器疱疹：一般是由于单纯疱疹病毒感染泌尿生殖器及肛门周围皮肤黏膜而引起，通常伴有红斑、皮疹等症状，一般建议在医生指导下使用阿昔洛韦片、盐酸伐昔洛韦片、阿司匹林肠溶片、莫匹罗星软膏等药进行治疗。 生殖器上长水泡，如果治疗期间，保持健康的生活习惯，注意个人卫生，注意清洁，避免辛辣刺激性食物，忌烟忌酒，避免熬夜。在日常生活中一定要注意不要随意使用别人的毛巾、内衣、浴盆等等，在公共场所不要随意接触使用到一些公共产品。