内分泌功能减退性疾病的治疗，通常包括对症治疗及病因治疗，具体的治疗方案选择需结合疾病种类进行判断。对症治疗通常以激素补充治疗以及生活控制为主。
例如甲状腺激素分泌减退诱发的甲减，可在医生指导下选择甲状腺激素制剂进行激素补充治疗。胰岛素分泌减退导致的糖尿病，可在医生指导下使用胰岛素制剂进行激素补充治疗，并严格控制饮食。
病因治疗方面，需根据原发疾病种类进行治疗。例如垂体瘤所导致的中枢性甲减，可在对症治疗基础上，针对垂体瘤进行手术、放疗等处理。
长期高糖毒性抑制导致的胰岛素分泌量减低，可短时间使用胰岛素强化降糖，以缓解高糖毒性对于胰岛素分泌的抑制作用。