孕39周自慰对胎儿会造成以下不良影响：
1、自慰时如果动作过于剧烈，很容易刺激子宫，导致子宫收缩异常，可能会出现早产的现象。
2、自慰时如果不注意手部卫生，还可能会导致细菌上行引发感染，从而造成早产。建议孕晚期不要进行自慰，并且要注意卫生，还要做好待产的准备。如果自慰后出现阴道出血、腹痛等症状后，应及时就医，以免造成不良后果发生。