导致巧克力囊肿形成的常见原因如下：
1、先天性原因：由于胚胎发育不正常，导致子宫颈口狭窄，或者是先天性子宫口闭锁，引起经血排出不畅，形成巧克力囊肿。
2、分娩、多次流产等：巧克力囊肿是由于月经期子宫内膜碎片引流不畅导致的，影响月经血从阴道流出，包括多次人工流产后子宫颈口粘连、月经期性交等，都会促发巧克力囊肿。
3、内分泌因素：是比较常见的卵巢囊肿的病因。卵巢是产生卵子并排卵和内分泌激素以及平衡内分泌的重要生殖器官。建议进一步去医院做详细检查，明确具体病因后在医生指导下对症治疗。