脖子上长扁平疣，多由免疫力低、病毒感染所致，通过与病变患者的直接接触或与患者污染的物品间接接触传染，也可通过母婴传染或自体接种传染。
1、免疫力低：人体对HPV(人乳头瘤病毒)有普遍易感性，本身免疫力低下者或长期服用糖皮质激素等免疫抑制剂者，感染HPV后可能会导致脖子上出现扁平疣。
2、病毒感染：脖子上的扁平疣由HPV(人乳头瘤病毒)感染导致，患者接触HPV感染的患者或接触被HPV感染者污染的物品时，HPV病毒可侵入人体皮肤或黏膜上皮细胞，导致细胞增生而发生病变。可遵医嘱应用咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素软膏等药物治疗。 在日常生活中需注意保持物品清洁，定期消毒，剧烈瘙痒和发红也可以作为治愈的前兆。在积极治疗的情况下扁平疣可在两年内自行消退，少数患者可再复发。