感染幽门螺杆菌后，通常采用四联疗法治疗，包括一种质子泵抑制剂，比如艾司奥美拉唑、奥美拉唑等；还有青霉素类抗生素，通常使用阿莫西林胶囊；
另一种抗生素是大环内酯类药物，通常使用克拉霉素；另外联合胃黏膜保护剂，通常用的是含有铋剂的胃黏膜保护剂，上述四种药物联合应用便是四联疗法。
联合使用上述药物5-7天，可以清除幽门螺杆菌，但随着耐药菌或耐药现象增加，目前推荐的是10-14天的联合治疗方案。