小金丸和逍遥丸从功用和主治上各不相同。逍遥丸有疏肝解郁、养血健脾的功用，用于治疗由于肝郁血虚引起的脾胃虚弱，症见两胁胀痛、头痛目眩、咽干、女子月经不调及乳房胀痛。
小金丸为理血剂，功效是散结消肿、化瘀止痛，用于治疗痰气凝滞引起的有形的可以触摸到的疾病如瘿瘤或乳房结节。逍遥丸偏于治疗由于无形之气引起的症状，小金丸用于治疗痰气凝滞后有形的可以触摸到的疾病。
不能说哪种好，应根据病情选择合适自己的药物。