法莫替丁的副作用包括脉率增加、颜面潮红等循环系统表现；腹胀、恶心、呕吐、腹泻、便秘等消化系统表现；头痛、乏力、嗜睡、焦虑、幻觉、语速加快等中枢神经系统表现。
部分患者还可出现过敏反应、月经不调、面部水肿和耳鸣等不良反应。孕妇及哺乳期妇女禁用。此外，严重肾功能不全患者禁用该药。
以上药物服用时，应在医生的指导下进行服用，不可自行服用，以免产生不良反应。