长期服用奥美拉唑有副作用。奥美拉唑是强效的抑酸药,能够抑制胃酸的分泌。长期服用奥美拉唑，也是有可能会出现一些副作用的，如可能会由于抑制胃酸的分泌，长期会影响到消化功能，可能会出现胃部的胀气，以及恶心或者便秘，腹部不适等。
此外，因奥美拉唑为质子泵抑制剂，长期服用可能会影响机体对营养物质的吸收，从而出现低血糖、低镁血症、低钙血症等情况。
建议在医生的指导下规范用药，避免自行服药对身体造成不良的影响。