疱疹和梅毒都属于性行为传播的疾病，早期梅毒治疗起来相对容易一些，晚期梅毒会累及到神经系统的病变，治疗起来就会很困难，而生殖器疱疹比较容易复发，相比较梅毒可能更严重些。
梅毒是感染梅毒螺旋体引起的，生殖器疱疹是由于单纯疱疹病毒所引起的生殖器或者肛周皮肤黏膜的病变，两者都通过性传播，两者晚期的治疗都相对困难。
总体来说，梅毒的危害性大一点，晚期梅毒可以引起心血管神经系统以及内脏，骨骼等损害，相对更严重一点。不论哪种疾病，确诊后都应该及时的进行规范治疗，不要拖延，以免耽误病情。