卡培他滨常见的副作用有： (1)心脏副作用，如心肌损伤。(2)胃肠道反应，如恶心、呕吐等。(3)全身症状，虚弱等。
(4)免疫抑制，可继发感染。(5)肌肉骨骼：背痛、肌痛、关节痛。(6)手足综合征。(7)神经系统病变，如外周神经炎。
(8)眼：眼涩。(9)呼吸系统：呼吸困难、咳嗽。(10)骨髓抑制，白细胞下降等。卡培他滨是氟尿嘧啶类化疗药物。临床上常见的是胃肠道反应及骨髓抑制。