肺部肉芽肿有一小部分会出现癌变,大部分是良性的。通常要用病理诊断，病理诊断同时还可以明确是肉芽肿还是癌性病变。如果是肉芽肿，还可以明确是感染性的、结核性的还是免疫系统相关疾病引起来的肉芽肿，为治疗提供很好的帮助。
如果在病理诊断中看到肿瘤细胞。肺部肉芽肿病变主要表现在ct影像学上，可以看到边界比较清晰，结节状的阴影一般说边界比较清晰的阴影，癌症的可能性相对比较小，但是ct很难确定病变的性质，因此对于这一类的结节状的阴影都要采取病理诊断。
病变可以明确是恶性病变，当发现是恶性病变时，需要给予手术，必要时给予手术切除。