如厕后尿道刺痛需根据不同的病因采取对应的治疗方式：
一、如果是性传播疾病包括淋病疾病引起尿痛。需根据细菌的不同，进行针对性的抗生素的治疗。
二、尿道炎症的刺激作用引起尿道刺痛，多见于膀胱炎、尿道炎以及一些性病。这些情况都会引起尿道黏膜的炎症后的刺痛、刺激，造成排尿的疼痛。做尿常规、尿细菌培养、B超等检查,根据检查结果给予合理有效的抗生素治疗。
三、如果是尿道结石引起的，可以通过多喝水的方式，继续观察。如果刺痛不缓解或者每次上完厕所后，尿道都有刺痛感就要建议去医院进行检查，还是要到正规的医院的泌尿外科和男科进行尿常规的检查。