中医认为，肾气不充、气化不利，是形成结石的主要内在因素。从中医角度讲，肾结石属于砂石淋的范畴，肾结石的形成原因主要与肾气不充、气机淤滞以及饮食不当相关。
而结石形成后，气血淤滞逐渐转为矛盾的主要方面。结石内阻、久留不去，必然会导致气血阻滞，膀胱气化不宣而愈甚的病理机制，所以气机淤滞是肾结石的主要病理机制。
此外，体内草酸的大量积存，是导致肾结石的因素之一。如菠菜、豆类、葡萄、可可、茶叶、桔子、土豆等常见的食物，都是含草酸较高的食物，肾结石病人应少吃。
中医在治疗肾结石，要辩证论治，根据患者的具体情况会采用不同的方剂进行相关的治疗。