肛管癌的早期没有特异的临床症状。随着病情的进展，会出现大便习惯的改变。表现为以下一些症状：
1、肛管癌在早期可发现肛管有小肿块，可没有疼痛，没有任何感觉。随着病情进展，肿块可增大，表面可能会有破溃、流血，或者伴有疼痛、感染等，破溃长期不愈合，破口会不好长。肿块进一步长大，可引起剧烈疼痛或不适感，可引起腹股沟淋巴结或其他部位淋巴结转移，患者可伴有发烧或严重不舒服等。
2、排便次数的增多，以及经常伴有排便不尽的感觉，大便成细条状或者变细，大便的表面有脓或者脓血、粘液。随病情进展，还可有消瘦、食欲不振的症状，再严重可出现肠梗阻、大出血，还可出现肝转移、肺转移。
3、肛门的疼痛，肛门周围的不适。特别是大便后的症状更加明显，也有的病人表现为肛门的瘙痒。 肛管癌可以通过肛门指诊早期发现，早期诊断。治疗方法类似于直肠下段癌，手术治疗是其主要的治疗手段。随着疾病的期别不同，症状也不同，需高度重视。