鼻咽囊肿大多数是不会癌变的，鼻咽囊肿属于良性的病变，而鼻咽癌属于恶性疾病。鼻咽囊肿一般指的是咽囊炎，也被称为咽黏液囊炎等，大多数情况下无任何症状，体积增大可有异物感或耳部压迫感，感染时则会有疼痛，囊脓肿自行破裂后，会形成脓性的小瘘管，通常在进行口咽视诊或间接喉镜、鼻咽镜等相关检查时被发现，通常需要与鼻咽炎、慢性咽炎等相鉴别。
鼻咽癌是发生在鼻咽部的恶性肿瘤，出现的原因主要和遗传因素、反复炎症刺激因素有关。对于鼻咽囊肿疾病，如未感染或体积不大，完全可以保守观察，若体积增大，可需要病理作为金标准，才能最后确定。
虽然能从临床表现或者局部表现做出大概判断，但是想明确诊断，还要依靠病理诊断来区分。所以鼻咽囊肿大多数不会出现癌变，需要尽快的接受检查和治疗，不能延误病情，以免影响患者的生活质量。