肝囊肿介入治疗效果较好，一般比较理想。肝囊肿的介入治疗，一般是通过彩超或者是CT引导下，向肝囊肿中心刺入一个穿刺针，将肝囊肿的囊液抽出，然后向囊内注入一些无水乙醇等一些硬化剂，使囊壁发生凝固性的坏死，导致囊壁失去了分泌功能，逐渐使囊肿萎缩。
介入治疗相对于腹腔镜下肝囊肿去顶术来说可以不用全麻损伤也较腹腔镜的更小，但较大的囊肿做介入手术可能需要两次或多次治疗。