肛门尖锐湿疣引起的原因是因为感染人类乳头瘤病毒，同时肛门部皮肤长期不洁或分泌物刺激、摩擦，而引起皮肤慢性炎症性损害，继而会导致感染人类乳头瘤病毒。
肛门尖锐湿疣一般包括肛周和肛管尖锐湿疣，可以单独在肛周或肛管有尖锐湿疣，也可以同时两个部位都有尖锐湿疣，也可伴发其他部位，如女性小阴唇、大阴唇、男性阴茎龟头、包皮等部位同时发生尖锐湿疣。
大部分通过性途径感染，也可以通过间接途径感染。如果确诊，主要是物理治疗和手术治疗等。医生会根据皮损的大小、数量、位置、治疗花费、治疗副作用和患者治疗经历等因素制定个体化的治疗方案，采取综合防治策略，达到最满意的疗效。
此外，患者对治疗的偏好、依从性和医师专业水平等也会影响治疗的选择。