治疗腹泻型肠道易急综合征轻者可使用活性炭和蒙脱石进行治疗，严重者可使用洛哌丁胺等止泻药物进行治疗。还可使用匹维溴铵、抗胆碱药物等治疗腹痛。
还可口服双歧杆菌来调节肠道菌群。肠道易激综合征的主要症状是腹泻、便秘，同时伴有腹痛，解过大便以后，腹痛会缓解。建议在治疗期间要保持心情舒畅，并在医生指导下使用药物进行治疗。