九制大黄丸的主要作用是泻下导滞，可以有效治疗肠胃垃圾堆积和肠道便秘，也可以治疗身体口渴、消食化滞、胃肠积滞或者是小便赤黄、大便燥结等。
九制大黄丸所含有的大黄成分能够解除毒素，祛除血瘀问题，而且还可以缓解闭经情况，通常泄热，驱逐通经，解毒凉血的效果也非常明显。
九制大黄丸与其他药物同服可能会发生药物的相互作用，所以服药要在医师的指导下进行；孕妇、过敏体质者、对药物成分过敏者慎用；
该药为寒凉药，可伤脾胃，故不宜久服；服药后症状没有改善或者加重，应尽早就医诊治。