甲硝唑主要用于治疗厌氧菌引起的感染，首先对甲硝唑或其它硝基咪唑类药物过敏者应禁用；患有活动性中枢神经系统疾病和血液疾病的患者应禁止食用甲硝唑；
另外，肾功能衰竭患者、严重肝功能减退患者，以及儿童、哺乳期及妊娠期妇女应慎用。由于用药具有专业性，甲硝唑的服用需在医生的指导下进行，不可私自乱用药物，以免出现不良反应。