与甲胎蛋白明显相关的肿瘤是原发性肝癌。甲胎蛋白属于白蛋白家族，是一种糖蛋白，其在胎儿时期主要由卵黄囊及肝细胞合成，在成年时便成为一种病态的肿瘤标志物，用于肝癌的诊断及疗效的监测。
一般在妊娠状态下体内的甲胎蛋白含量也会升高，若排除妊娠状态，AFP值大于或是等于400微克/升，则可以考虑肝癌的诊断。
也可以说甲胎蛋白对于肝癌的诊断具有一定的特异性。