整肠生的作用是在口服以后可以在肠道内迅速生长繁殖造成低氧环境，对于双歧杆菌、乳酸杆菌、拟杆菌，消化链球菌等有益健康的厌氧菌生长繁殖有促进的作用，而对葡萄球菌，白色念珠菌等致病菌有拮抗作用，可以起到调节肠道菌群失调，维持肠道微生态平衡的作用。
主要是用于治疗细菌或真菌感染引起的急慢性肠炎、腹泻，也可以用于肠道菌群失调引起的肠功能紊乱。