小孩子手指甲凹凸不平的引发原因具体如下：
1、小孩子的手指甲受到真菌感染之后，也有可能会引起指甲凹凸不平，所以这种情况下需要去医院做真菌检查。
2、可能是因为小孩子长期挑食或者偏食而引起的营养不良，这种情况下可以去医院做微量元素检查。
3、有可能是因为小孩子本身就存在甲床先天性发育异常的问题，一般是无法治疗的。