三岁宝宝腿疼的原因如下：
1.生长痛：可能是由于骨骼，肌肉，肌腱韧带发育不平衡导致的。
2.活动量大：过度活动容易导致乳酸聚集在组织细胞间，刺激神经末梢导致的。 可以给宝宝服用龙牡壮骨颗粒补钙补充维生素D,改善发育较快过程中出现的生长痛症状。建议及时去医院检查，明确病因，在医生的指导下进行治疗，用药谨遵医嘱。