鹅口疮的治疗包括局部用药、全身用药、饮食餐具卫生等。局部用药：一般用制霉菌素，把制霉菌素碾碎，或者是液体状的涂到局部有鹅口疮的部位上，一般用一到两天的时间就很快能够缓解。
全身用药：症状严重的孩子也可口服一些抗真菌的药物，如制霉菌素或克霉唑等，进行综合治疗。饮食餐具的卫生。奶瓶、奶头、碗勺等专人专用，使用后用碱水清洗，煮沸消毒，母乳喂养者每次喂奶前，母亲应先洗手，清洁乳头。
鹅口疮一般好发于婴幼儿，此时应该及时就医。如果是成人患有鹅口疮，应该考虑存在自身免疫缺陷疾病，应及时找出相应病因进行治疗。