代糖吃多容易导致肥胖、糖耐量异常等危害，不宜多吃。代糖的优点是热量低，甜度高，可以减少热量的摄入，而且不会使餐后的血糖水平升高，对防治肥胖症和糖尿病有帮助。
但是习惯性地食用一些品种的代糖可能导致葡萄糖耐量的异常，从而引发或加重糖尿病。因为食用代糖后，人体血糖水平不升高，使得大脑做出促进进食的反应，或者人们对甜味的感觉会变得迟钝，进而摄入更多更甜的食物，最终导致肥胖及其相关慢性疾病。
有些代糖可能影响肠道菌群，从而促进葡萄糖不耐受。总体来说，对于有需要的人群，如糖尿病患者，代糖的确是减少添加糖摄入、控制血糖的有效手段，在合理范围内使用是安全的。
但若长期大量服用代糖，即可产生肥胖、糖耐量异常等问题。