导致月经快干净了有褐色分泌物的原因有：疾病原因（贫血、多囊卵巢综合征）及非疾病原因（生理情况、不良生活习惯），具体分析如下： 1、疾病原因：贫血：长期贫血，铁元素的缺乏会影响激素分泌异常。
导致月经快结束时，量少呈褐色。建议补充叶酸、维生素B12、硫酸亚铁等；多囊卵巢综合征：会出现排卵功能障碍及雌激素水平低，导致月经稀发，快结束时有褐色分泌物。
需用炔雌醇环丙孕酮、屈螺酮炔雌醇、来曲唑等药物增加雌激素水平，促进排卵。2、非疾病原因：正常生理情况下月经会持续2～7天，月经快结束时，由于月经量减少，经血在阴道留存时间长，氧化为褐色，属于正常现象；
不良生活习惯：经期精神紧张，受恐惧，忧虑等负面情绪影响；作息不规律：高强度工作，熬夜，生活环境的改变等。建议出现月经快干净时有褐色分泌物，要及时到医院，查明病因，并遵医嘱治疗。
以上药物要在医生指导下使用。