男性霉菌性感染的治疗以局部用药为主如抗霉菌药膏；也可配合口服药物。男性霉菌性龟头炎用药方式首先可使用生理盐水或者阴部清洗液，对阴茎和包皮进行冲洗后，待局部干燥后，可使用克霉唑软膏药物进行局部涂抹。
口服药物可以通过霉菌素或者氟康唑等药物。男性霉菌性龟头炎感染的患者应注意局部卫生清洁，每天对龟头和龟皮进行清洗，如果男性有包皮过长，经常反复出现龟头炎或者是其他疾病，必要时可采取包皮环切术，同时注意避免性生活，防止交叉感染。
用药谨遵医嘱。