阴茎疼痛分内部疼痛、表面疼痛，可能是包皮过长、龟头炎、尿道炎等原因引起的。
1、包皮过长：包皮过长没有做好及时的处理措施，容易引起包皮嵌顿，导致静脉的回流受阻，阴茎部位出现水肿、充血，从而导致阴茎部位出现疼痛。
2、龟头炎：龟头炎因为局部的感染，导致龟头部位的皮肤黏膜水肿、糜烂、溃疡，疼痛向上放射时引起阴茎部位疼痛。
3、尿道炎：主要是因为病原体在入侵后可导致尿道出现一系列症状，如尿道刺痛、尿频、尿急、排尿困难等，此时还会对神经的放射产生影响，进而出现阴茎部位的神经放射痛。阴茎出现疼痛应引起重视，可就医检查，对因治疗。