查激素月经第二天和三天的差异不大。查激素一般是性激素六项的检查，一般检查的日期是在经期的第2-5天，通常在经期第2-3天检查为好。
这个时期处于卵泡早期，可以根据检查结果判断卵巢的功能，激素分泌水平等是否有异常。月经第2-5天抽血检查性激素，可以不检查孕酮。
孕酮的分泌水平应该在黄体期，即月经第21天或者排卵期后7天检查。患者进行激素检查前要空腹，检查前一天要保证充足的睡眠和饮食清淡。