肛门退热栓是相对比较安全的药物，副作用主要有头晕、乏力、嗜睡、呕吐、皮疹等轻微症状，一般不会出现休克、死亡等严重副作用。
肛门退热栓吸收部位在直肠，通过静脉进入全身血液循环，药物会到达作用部位发挥药效。应用退烧栓期间，禁止饮酒；对乙酰氨基酚过敏者，严重肝肾功能不全者，应禁用；
避免合并使用含有对乙酰氨基酚的多个解热镇痛药，防止药物过量或导致毒性地加剧。患者用药需在医生指导下进行，不可私自乱用药物，以免产生不良反应。