打新冠疫苗发高烧39摄氏度可以选择物理降温或者药物降温等方法。
1.物理治疗：可以选择冰毛巾敷额头，用酒精擦拭身体等。多喝水，多注意休息，避免劳累以及剧烈运动等。如果物理降温没有效果，可以选择口服药物治疗。
2.药物治疗：可以选择布洛芬或者对乙酰氨基酚等药物进行消炎退热治疗，以上药物需要在医生的指导下使用。新冠病毒疫苗接种后出现发热的原因与机体的免疫系统有关。如患者持续发热，建议及时就医，以免延误病情。