龟头肿痛流脓可能是因为局部外生殖器感染导致的，患者还有包皮炎、龟头炎等疾病，也可能是细菌感染。可以使用静脉点滴抗生素，包括喹诺酮类和氨基糖苷类抗生素，流脓严重者还要对龟头局部进行切开排脓。
如果是尿道口部位流脓，因怀疑是淋病导致的。淋病也就是淋菌性尿道炎，治疗较简单，主要以青霉素类、头孢类、喹诺酮类等抗生素类药物治疗为主，需要静脉输液1~2周的时间。
建议患者应及时就医，以上药物需在医生的指导下使用，不要自行用药，以免造成不良后果。