气管镜常见的后遗症有低氧血症，术中、术后出血，喉痉挛，气胸及术后发热，具体分析如下：
1、低氧血症：一般插管时会有患者血氧下降，操作时间越长，下降幅度越大。有时可诱发心律失常、心肌梗死等表现。
2、术中、术后出血：被手术者有不同程度的出血，有可能是插管时导致局部黏膜出血或因插管中剧烈咳嗽诱发出血。如果出血量较大时，可采取止血药物治疗。
3、喉痉挛：多为麻醉药导致的并发症，可在支气管哮喘和慢性阻塞性肺疾病插管时发生。有时还会表现为呼吸印制、抽搐等。
4、气胸：多是因为在支气管镜下做肺组织活检引起，发生率较低。
5、术后发热：是继发肺部细菌感染，菌血症等引起。建议气管镜检查后要注意观察患者，若出现以上症状，要及时就医。