两者的生长位置不同、伴随症状不同、发展结局不同及发生机理不同等方面有所不同，具体分析如下：
1、生长位置不同：卵泡只存在于卵巢内，而其他囊肿既可生长在卵巢，也可存在于输卵管、系膜等部位。
2、伴随症状不同：卵泡一般不会伴随有其他不适，但病理性囊肿患者还可能出现腹痛、阴道出血、排便异常等症状。
3、发展结局不同：当卵泡发育成熟后即自行排出，囊肿自行消失。但病理性囊肿如果不采取药物或手术干预，会持续性存在和发展。
4、发生机理不同：卵泡的产生属于育龄期女性正常生理过程。病理性囊肿主要是因内分泌紊乱、生活习惯不良、感染、妇科手术、妇科疾病导致的。无论患有哪种疾病，都要及时到医院积极治疗。