甲亢的治疗药物有甲巯咪唑和丙硫氧嘧啶，通过抑制甲状腺过氧化物酶和碘离子的有机化，从而抑制甲状腺激素合成。甲巯咪唑和丙硫氧嘧啶主要抑制甲状腺激素合成，不能抑制甲状腺激素释放，服用一段时间后才能起效。
服用甲巯咪唑和丙硫氧嘧啶期间需要注意监测肝功能、血常规，防止出现过敏的情况。通常服用后第一周、第二周需要检查血常规和肝功能，在第一周和第二周血常规、肝功能正常的情况下，可以一个月复查一次血常规和肝功能，同时复查甲功，调整甲巯咪唑或丙硫氧嘧啶的剂量。
在监测过程中出现白细胞下降或肝功能升高，可以辅以升白细胞和保肝的药物。发生严重的白细胞减少或严重的肝功能升高时，需要停用甲巯咪唑或丙硫氧嘧啶，改用碘-131或手术治疗甲亢。