艾灸的最佳时间是因人而异的，和患者的通常是在30分钟至2个小时。艾灸的时间不能过短，不然药力没办法渗透，治疗效果不理想，通常在30分钟左右。
但有些特殊部位，如脸部周围的穴位，可以艾灸20分钟左右。艾灸时间也不能太长，一般不超过2小时。部分患者在艾灸之后可能会出现头晕胸闷，是因为血液流通加快，造成艾灸时产生的热量传导和扩散。
可以等身体恢复后再继续。建议患者在专业医生的指导下进行艾灸。