双歧杆菌乳杆菌三联活菌胶囊的主要作用是调节肠道菌群，治疗肠道菌群相关性疾病。双歧杆菌乳杆菌三联活菌胶囊可以治疗常见的导致肠道菌群失调的疾病，比如急性肠炎、溃疡性结肠炎、肠结核、克罗恩病、肠道良恶性肿瘤等疾病，缓解或者治愈腹痛、腹泻、便秘等症状。
还可以促进消化、增加食欲、缓解纳差、恶心、呕吐等不适的症状。应用该类药物期间，要避免使用抗菌素类的药物，避免吃辛辣刺激性、生冷的食物，服用时要用适宜温度的水或牛奶送服，避免过烫。