肛周脓肿的治疗方法包括保守治疗和手术治疗。一、保守治疗适： 1、判断致病菌的种类，选用有效的抗生素和磺胺类药物，常用的药物有青霉素、卡那霉素、庆大霉素、链霉素、磺胺类药物。
2、局部使用玉露膏、鱼石脂软膏、消炎止痛膏等外敷，用祛毒汤或1:5000高锰酸钾便后坐浴。二、手术治疗： 1、切开引流术：适用于高位脓肿，全身症状重的患者，适用于体质虚弱或不愿住院治疗的深部脓肿。
2、一次切开术：适用于肛周皮下脓肿，低位肌间脓肿、肛管后间隙脓肿。3、切开挂线术：适用于所有高、低位脓肿，一般以肛提肌以上脓肿多采用，小儿脓肿也采用此法。
平时要注意局部卫生，饮食方面应当多吃一些容易消化的食物，适当多吃一些新鲜的水果蔬菜。