胸腺法新通常可以用作皮下注射，不可以进行肌肉注射或者静脉注射，常见的副作用有过敏反应，部分患者有注射部位的疼痛，慢乙肝患者有出现转氨酶暂时性波动的副作用，一般不用停药，如果出现严重的不良反应，需停药就医。
胸腺法新是免疫调节剂，目前不良反应比较少，只有极少数的患者可能会有局部注射部位的不适症状，其他的不良反应目前比较少见，对身体没有太大危害。