甲状旁腺功能减退的病因，主要由于甲状腺手术损伤或自身免疫性损伤，其他还包括遗传性疾病及其它疾病引起。
1、手术因素：甲状腺手术是最常见的导致甲状旁腺功能减退的病因，甲状腺手术、甲状旁腺手术或治疗头颈癌的颈部根治性手术，均可造成甲状旁腺功能减退，其可能为一过性，在数日、数周或数月内恢复，也可能为永久性，甚至可能为间歇性。
2、自身免疫因素：免疫介导的甲状旁腺破坏通常引起永久性甲状旁腺功能减退。永久性甲状旁腺功能减退是自身免疫性多内分泌腺病、假丝酵母菌病、外胚层营养不良综合征的一部分，该综合征又称Ⅰ型自身免疫性多发内分泌腺病综合征，是自身免疫调节因子基因突变的结果。
3、遗传因素：婴儿和儿童可能出现甲状旁腺发育异常相关缺陷引起的遗传缺陷疾病，包括单纯性甲状旁腺功能减退、甲状旁腺功能减退合并先天性多系统异常、甲状旁腺功能减退合并先天性代谢异常，以及甲状旁腺抵抗综合征。
4、其他因素：甲状旁腺破坏所致甲状旁腺功能减退，其病因包括甲状旁腺放疗和甲状旁腺贮积性、浸润性疾病，例如血色病、肝豆状核变性、肉芽肿或转移性癌，但都非常少见。 甲状旁腺功能减退的症状非常多，比如癫痫发作、精神过于兴奋、焦虑、出现幻觉、低钙性白内障、骨骼疼痛等症状。可在医生的指导下补充钙剂和维生素D，可以有效控制症状，抑制病情的发展。