甲状腺囊肿和结节两者首先有本质的区别，分别如下：
1、甲状腺囊肿是囊性的，囊内容物多为液体。甲状腺结节是一个实性的结节。
2、甲状腺结节是一种非常常见的疾病，具有良、恶性之分，并且良性结节占大多数，恶性结节占比较少数。而甲状腺囊肿绝大部分都是良性的。临床上有多种甲状腺疾病，如自身免疫性甲状腺炎、甲状腺退行性变、甲状腺肿瘤等。
3、甲状腺结节包括甲状腺囊肿。甲状腺囊肿一般是在甲状腺中发现有液体的囊状物，肿块呈圆形，直径多在2到5公分之间，一般不疼或是有轻微疼痛，随着吞咽上下移动，多数是单发结节，少数为多发。 不管是甲状腺囊肿还是结节都应该要尽早到医院治疗，明确诊断后方可进行有效的治疗。