消化不良通常患者的大便会伴有明显的酸臭味，而且大便是不成型的，可能是稀水样便，也可能是糊状的粪便。有部分患者的粪便中还可以看到食物残渣。
还有部分患者出现便秘的症状。消化不良的患者,因为食物不能在胃肠道中被很好地消化、吸收,然后会发酵产生很多气体,患者会觉到腹胀,会排很多的气体。
消化不良患者可以出现腹泻或者是便秘现象。如果是腹泻，患者大便会不成型，呈稀水样，还可能出现未完全消化的食物，并且伴有明显酸臭味。
如果是便秘，患者的大便一般比较干硬，可以呈现栗子状，排出困难。如果出现以上症状，建议进一步去医院做详细检查，明确具体病因后在医生指导下对症治疗。